Sakko Otori é aluno de uma escola particular especial, a Academia Enoshima, mas é rejeitado pelos colegas por sua personalidade. Sua amiga de infância, Sayo Ichiki, faleceu tragicamente, e ele deixou um cravo para ela no velório. Um outro dia, na escola, Sayo aparece como se nada tivesse acontecido, falando sobre coisas que aconteceram há 12 mil anos.
